Antecedentes: Os potenciadores transcricionais geralmente, mas nem sempre, regulam genes dentro do mesmo domínio de associação topologicamente (TAD). Nossa hipótese é que esse isolamento incompleto deve parcialmente às estruturas tridimensionais dos domínios da cromatina correspondentes em células individuais: enquanto potenciadores e genes enterrados dentro do núcleo de um domínio interagem principalmente com outras regiões no mesmo domínio, na superfície podem interagir mais facilmente com o exterior.
Resultados: Aqui mostramos que uma medida simples, a razão intra-TAD, pode quantificar a centralidade de uma região em relação aos domínios unicelulares aos quais ela pertence. Mostramos que as superfícies do domínio são permissivas para alta expressão gênica. Elementos cis-reguladores ativos específicos do tipo de célula, marcas de histonas ativas e locais de ligação do fator de transcrição são enriquecidos nas superfícies do domínio, mais fortemente nos subcompartimentos da cromatina normalmente considerados inativos.
Conclusões: Essas descobertas sugerem um modelo de regulação gênica que envolve o posicionamento de elementos cis-reguladores ativos nas superfícies do domínio. Também descobrimos que as variantes não codificantes associadas a doenças são enriquecidas nas superfícies do domínio.