Histórico: Nos cânceres epiteliais associados ao EBV, apenas um número limitado de proteínas virais é traduzido, enquanto vários RNAs não codificantes codificados pelo EBV são expressos para minimizar a ativação da resposta imune do hospedeiro. Foi demonstrado que esses RNAs não codificantes desempenham papéis regulatórios na manutenção da latência e na promoção da progressão do câncer, enquanto muitos aspectos deles ainda precisam ser elucidados.

Resultados: Aqui, revelamos a expressão abundante de EBV-SISRNA-3, um novo transcrito de EBV no carcinoma nasofaríngeo e no câncer gástrico associado ao EBV. Este transcrito não-polímero de 5-7 kb é derivado do íntron RPMS1 e é parcialmente complementar ao LF3. Observamos alto nível de expressão de EBV-SisRNa-3 em várias células cancerosas EBV-positivas e amostras clínicas, com acúmulo no núcleo celular. Notavelmente, o EBV-SisRNA-3 invade o DNA de fita dupla em trans a montante da origem da replicação lítica no genoma do EBV e leva à formação de R-loop e G-quadruplex simultaneamente nas células epiteliais latentemente infectadas pelo EBV. Além disso, revelamos as localizações dos loops R no genoma do EBV e identificamos quadruplexes G endógenos próximos aos promotores EBER1 e EBNA1.

Conclusões: Neste estudo, revelamos e caracterizamos um novo transcrito do EBV EBV-SISRNA-3 amplamente expresso em células infectadas latentemente. As estruturas únicas de R-loop e G-quadruplex de ligação ao EBV-SisRNA-3 próximas à origem da replicação lítica podem desempenhar um papel significativo na replicação lítica do EBV.

Palavras-chave: Vírus Epstein-Barr; G-quadruplex; carcinoma nasofaríngeo; R-loop; ncRNA; sisRNA.