A progressão do câncer envolve perda de diferenciação e aquisição de características semelhantes às células-tronco, amplamente referidas como “tronco”. Aqui, testamos se o nível de tronco, avaliado por um escore de Stemness derivado do transcriptoma, pode rastrear quantitativamente o desenvolvimento, a progressão, a resistência à terapia, metástase, plasticidade e sobrevida do paciente. A análise integrativa de 3.102 amostras de RNA-seq e 84.081 microarranjos em 26 conjuntos de dados revela um aumento progressivo na célula e declínio na atividade do receptor de andrógeno de pró-diferenciação (AR-A) ao longo do continuum do PCa, com o PCa metastático resistente à castração (mCRPC) exibindo a maior escala e o menor AR-A. Tanto o escore geral de Stemness quanto o recém-desenvolvido “PCA-Stem Signature” de 12 genes se correlacionam e predizem resultados clínicos ruínas. Mecanicamente, o aumento de AR-A pode promover o caule no PCa em estágio inicial, enquanto a amplificação de MYC e a perda bialélica de RB1 provavelmente aumentam muito o caule em mCRPC, onde o AR-A é suprimido. Nossas descobertas estabelecem o Stemness como uma medida quantitativa robusta da agressividade do PCa e oferecem uma estrutura escalável para a estratificação do risco do PCa.