Os microRNAs são liberados das células em vesículas extracelulares (EVs), representando um modo essencial de comunicação célula-célula (CCC) por meio de um efeito regulador na expressão gênica. As tecnologias de sequenciamento de RNA de célula única deram início a uma era de elucidação do CCC na resolução de uma única célula. Aqui, apresentamos o miRTalk, uma abordagem pioneira para inferir CCC mediada por interações miRNA-alvo derivadas de EV (MiTIs). O benchmarking com conjuntos de dados simulados e do mundo real demonstra o desempenho superior do MIRTalk, e a aplicação em quatro cenários de doenças revela os mecanismos de CCC mediados pelo MITI em profundidade. Coletivamente, o miRTalk pode inferir o CCC mediado pelo MITI derivado de EV com dados de scRNA-seq, fornecendo novos insights sobre a dinâmica intercelular dos processos biológicos.

Palavras-chave: Comunicação célula-célula; vesícula extracelular; miRNA; scRNA-seq; transcriptômica espacial.