contendo uma sequência parcial de repetição de c-heptad (CHR) seguida por um loop curto e uma repetição n-heptad completa (NHR) formam trímeros em solução e são inibidores nanomolares da fusão mediada pelo HIV-1 Env. Seu alvo é o intermediário de fusão gp41 in situ, e eles têm potência semelhante a outros trímeros NHR relacionados anteriormente. No entanto, seu design implica que o NHR é parcialmente coberto pelo CHR, o que deveria limitar a potência. Uma bolsa hidrofóbica exposta na estrutura dobrada pode ser suficiente para conferir a potência observada, ou elas podem existir em um estado parcialmente desdobrado, expondo ou NHR de comprimento total. Aqui, examinamos sua estrutura por cristalografia, CD e fluorescência, estabelecendo que as proteínas são ganchos dobrados tanto na forma de cristal quanto em solução. Examinamos o desdobramento no meio da reação de fusão conduzindo experimentos na presença de um solvente mimético de membrana e projetando uma ligação dissulfeto na estrutura para evitar o desdobramento parcial. Examinamos ainda mais o papel da bolsa hidrofóbica, usando um aduto de pequena molécula em forma de gancho que ocluiu a bolsa, conforme confirmado pela etiqueta de raios-X. Os resultados demonstraram que a região NHR nominalmente coberta pela CHR nas construções projetadas e a região da bolsa hidrofóbica que é exposta por design foram essenciais para a potência nanomolar e que a interação com a membrana provavelmente desempenhará um papel na promoção da estrutura inibidora necessária. Os conceitos de design podem ser aplicados a outras proteínas de fusão viral de Classe 1.
Palavras-chave: antiviral derivado de Gp41; pegada de raios-X; ligante covalente; estrutura cristalina; estrutura lipídica alterada.
