Introdução: As características da microbiota intestinal multirretal (por exemplo, bacterioma, micobioma e viroma) do câncer colorretal foram amplamente estudadas, mas ainda há uma descrição insuficiente das características da microbiota em seu estágio inicial, o adenoma colorretal, particularmente no aspecto do viroma intestinal.
Métodos: Com base no catálogo do vírus metagenômico intestinal (MGV) contendo 54.118 genomas virais intestinais não redundantes, este estudo caracterizou a composição e diversidade do viroma usando dados de sequenciamento metagenômico disponíveis publicamente de 419 indivíduos com adenoma colorretal coma pré-maligno e 552 controles saudáveis. Além disso, identificamos e avaliamos a confiabilidade e o desempenho de classificação das assinaturas microbianas associadas ao adenoma por meio de análise comparativa e do modelo florestal aleatório.
Resultados: Nossos resultados revelaram uma mudança notável na estrutura do viroma intestinal de pacientes em comparação com controles saudáveis, caracterizada por um aumento significativo em famílias virais como Microviridae, Podoviridae_crass-like e Quimbyviridae. No nível da unidade taxonômica operacional viral (VoTU), identificamos 479 assinaturas de VoTu mostrando diferenças significativas nas abundâncias relativas entre pacientes e controles, incluindo alguns VoTus enriquecidos com pacientes que tendem a infectar Bacteroidaceae e Lachnospiraceae. A análise da rede de correlação revelou espécies bacterianas específicas correlacionadas com vírus associados ao adenoma, sugerindo interações frequentes entre elas. Além disso, modelos florestais aleatórios treinados em assinaturas virais e bacterianas intestinais demonstraram pontuações de área sob a curva (AUC) de 0,68, 0,82 e 0,76 para classificar indivíduos saudáveis versus pacientes com adenomas tubulares, pacientes com adenomas serrilhados sésseis e pacientes com ambas as condições, respectivamente. Em três coortes de validação independente, o desempenho da classificação alcançou pontuações de AUC variando de 0,61 a 0,65.
Conclusões: Nosso estudo fornece informações sobre o viroma intestinal no adenoma colorretal pré-maligno, destacando seu papel potencial no desenvolvimento e diagnóstico da doença. Investigações adicionais são necessárias para elucidar os mecanismos subjacentes às interações vírus-bactérias intestinais e validar modelos de diagnóstico em populações maiores.
Palavras-chave: Adenoma colorretal; viroma intestinal; metagenômica; microbiota; assinaturas virais.
