As micróglias são mediadoras centrais da neuroinflamação na doença de Alzheimer (DA), mas os estados microgliais conservados e as trajetórias de ativação em modelos de camundongos com DA permanecem incompletamente definidos. Aqui, construímos um Atlas de Microglia de Mouse abrangente (MoMICA) para resolver subtipos conservados, delinear trajetórias dinâmicas e identificar os principais reguladores associados à patologia da DA.