Definir o subconjunto de fatores celulares que governam a replicação do SARS-CoV-2 pode fornecer informações críticas sobre a patologia viral e identificar alvos para terapias antivirais dirigidas ao hospedeiro. Embora várias telas genéticas tenham relatado anteriormente fatores de dependência do hospedeiro SARS-CoV-2, a maioria dessas abordagens se baseou na utilização das bibliotecas CRISPR em escala de genoma agrupadas, que são tendenciosas para a descoberta de proteínas do hospedeiro que afetam os estágios iniciais da replicação viral. Para identificar os fatores do hospedeiro envolvidos em todo o ciclo infeccioso do SARS-CoV-2, conduzimos uma triagem de siRNA em escala de genoma. Os dados resultantes foram integrados a telas funcionais e dados proteômicos publicados para revelar (i) vias comuns que foram identificadas em todos os conjuntos de dados OMICS, incluindo regulação da sinalização Wnt e junções comunicantes, (ii) vias identificadas exclusivamente nesta tela, incluindo oxidação de NADH, ou (iii) vias suportadas por essa tela e dados proteômicos, mas não telas funcionais publicadas, incluindo produção de araquionato e sinalização painel de canalização MAPK. Os fatores do hospedeiro proviral foram mapeados no ciclo infeccioso do SARS-CoV-2, incluindo 32 proteínas que foram determinadas como impactando a replicação viral e 27 afetando os estágios finais da infecção, respectivamente. Além disso, um subconjunto de proteínas foi testado em outros coronavírus, revelando um subconjunto de fatores provisórios que foram conservados na pandemia de SARS-CoV-2, na epidemia de SARS-CoV-1 e MERS-CoV e no coronavírus sazonal OC43-CoV. Estudos adicionais iluminaram o papel do proteoglicano perlecano de sulfato de heparano na entrada viral do SARS-CoV-2 e descobriram que a inibição da via não canônica do NF-kB por meio do direcionamento do BIRC2 restringe a replicação do SARS-CoV-2 in vitro tanto quanto in vivo. Esses estudos fornecem uma visão crítica sobre o cenário das interações vírus-hospedeiro que impulsionam a replicação do SARS-CoV-2, bem como alvos valiosos para antivírus direcionados ao hospedeiro.
A triagem global de siRNA identifica fatores críticos do hospedeiro humano para a replicação do SARS-CoV-2 e estágios finais da infecção

A triagem global de siRNA identifica fatores críticos do hospedeiro humano para a replicação do SARS-CoV-2 e estágios finais da infecção
Publicado por PubMed
Definir o subconjunto de fatores celulares que governam a replicação do SARS-CoV-2 pode fornecer informações críticas sobre a patologia viral e identificar alvos para terapias antivirais dirigidas ao hospedeiro. Embora várias telas genéticas tenham relatado anteriormente fatores de dependência do hospedeiro SARS-CoV-2, a maioria dessas abordagens se baseou na utilização das bibliotecas CRISPR em escala de genoma agrupadas, que são tendenciosas para a descoberta de proteínas do hospedeiro que afetam os estágios iniciais da replicação viral.

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