O micobioma intratumoral desempenha um papel crucial no microambiente tumoral, mas seu impacto no carcinoma de células renais (CCR) ainda não está claro. Coletamos e traçamos o perfil quantitativo dos dados do micobioma intratumoral de 1044 pacientes com CCR em quatro coortes internacionais, das quais 466 pacientes receberam imunoterapia. Os pacientes foram estratificados em grupos com deficiência ecológica de micobiota e florescente em micobiota ecológica (MEF) com base na abundância de fungos. O grupo MEF teve pior prognóstico, maior diversidade de fungos, catabolismo lipídico regulado negativamente e células T CD8⁺ esgotadas. Desenvolvemos a assinatura da micobiota intratumoral e a assinatura de expressão de genes relacionados à micobiota intratumoral, que previram de forma robusta o prognóstico e os resultados da imunoterapia no CCR e em outros cânceres. Aspergillus tanneri foi identificado como uma espécie potencial de fungo chave que influencia o prognóstico do CCR. Nossos resultados sugerem que o microbioma intratumoral suprime o catabolismo lipídico e induz a exaustão de células T no RCC.